با توجه به رشد و گسترش کاربرد پرتوها در عرصه های تشخیصی و درمانی مانند (بخش های رادیوتراپی، پزشکی هسته ای، رادیولوژی و لیزر درمانی و...) نیاز به انجام تحقیقات گسترده در زمینه علوم پایه و در نهایت بالین، بسیار ضروری می باشد. در این راستا مرکز تحقیقات بیولوژی پرتو با هدف توسعه پژوهش های بنیادی، کاربردی و توسعه ای مرتبط با علوم پرتویی و متناسب با اولویت های تحقیقاتی کشور در تاریخ ۲۶/۰۲/ ۱۳۹۵ با موافقت اصولی صادره از طرف شورای گسترش وزارت بهداشت تاسیس گردید و از مهر ماه ۱۳۹۵ فعالیت خود را به صورت رسمی آغاز نموده است.
بر اساس نتایج ارزشیابی سال ۱۳۹۹ فعالیت های پژوهشی مراکز تحقیقات وابسته به دانشگاههای علوم پزشکی کشور (دولتی و خصوصی)، "مرکز تحقیقات بیولوژی پرتو" رتبه دوم در بین مراکز تحقیقات بیومدیکال فاقد ردیف مستقل بودجه یک تا پنج سال فعالیت دانشگاه ایران در سال ۹۹ را کسب کرده است.

به استناد رای صادره در دویست و هشتاد و ششمین جلسه شورای گسترش دانشگاه های علوم پزشکی، مورخ 1401/3/22 با تاسیس مرکز تحقیقات بیولوژی پرتو در دانشگاه علوم پزشکی ایران موافقت قطعی بعمل آمد.

مرکز تحقیقات بیولوژی پرتو یک مرکز متشکل از همکاری های تخصصی و بین رشته ای در راستای انجام فعالیت های پژوهشی و فناورانه در حیطه علوم پرتویی به منظور ارتقاسلامت و افزایش آگاهی عمومی و برقراری ارتباط آموزشی و پژوهشی با سایر مراکز تحقیقاتی و گروه های آموزشی دانشگاه ها و مراکز تولیدی و صنعتی می باشد و امکان ارتباط نزدیک و تنگاتنگ متخصصین (در زمینه های رادیوتراپی، رادیوبیولوژی، پزشکی هسته ای، آنژیوگرافی، رادیولوژی و حفاظت پرتویی، نانوفناوری، فارماکولوژی و ...  ) را در قالب یک مرکز تحقیقات مشترک فراهم می کند. این مرکز در نظر دارد نقطه اتکا محققینی باشد که تمایل به تحقیق و پژوهش در این حوزه را دارند تا بتواند با استفاده از نظرات تخصصی پژوهشگران و تولیدکنندگان علم، با برنامه‌ریزی مناسب پاسخگوی نیازهای جامعه باشد.